Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1A4Q13733 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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