Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL1Q13616 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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