Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEUROD1Q13562 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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