Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAMK2DQ13557 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAMK2DQ13557 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms