Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PPP1R1AQ13522 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PPP1R1AQ13522 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms