Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
XRCC4Q13426 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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