Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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