Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCGQ13326 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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