Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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STRN3Q13033 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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STRN3Q13033 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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STRN3Q13033 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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STRN3Q13033 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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STRN3Q13033 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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STRN3Q13033 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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STRN3Q13033 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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