Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HSPB3Q12988 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms