Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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