Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANK3Q12955 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANK3Q12955 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms