Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 PIH1D1-208ENST00000595633 424 ntTSL 212.67□□□□□ -0.389e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.399e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 312.6□□□□□ -0.399e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.399e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.399e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-201ENST00000374300 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE2I-209ENST00000562470 433 ntTSL 212.49□□□□□ -0.412e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSTA3-212ENST00000530474 823 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL928654.4-203ENST00000553228 337 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.46□□□□□ -0.419e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-278ENST00000515233 580 ntTSL 412.46□□□□□ -0.419e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.429e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NUP188-211ENST00000550219 886 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RPLP1-203ENST00000487304 1962 ntTSL 512.35□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-213ENST00000494293 804 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GNL3-207ENST00000474423 567 ntTSL 312.3□□□□□ -0.449e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.449e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 C14orf80-212ENST00000451719 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.25□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSTA3-210ENST00000529064 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RCOR3-211ENST00000528926 1497 ntTSL 212.22□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CARS-212ENST00000526890 5732 ntTSL 212.18□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MYO7A-204ENST00000458169 4616 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.479e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDX19A-215ENST00000575878 1533 ntTSL 212.08□□□□□ -0.489e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-205ENST00000577738 531 ntTSL 211.99□□□□□ -0.492e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 IPO4-206ENST00000558718 554 ntTSL 211.98□□□□□ -0.499e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.499e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANXA6-204ENST00000517677 795 ntTSL 511.91□□□□□ -0.59e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GSN-214ENST00000485767 6454 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.59e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-214ENST00000580461 909 ntTSL 211.81□□□□□ -0.522e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TIA1-213ENST00000481650 549 ntTSL 411.78□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-205ENST00000446294 2065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 SKIV2L-212ENST00000488648 720 ntTSL 511.68□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MARK4-203ENST00000587566 553 ntTSL 511.66□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 24.7
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SF3A3Q12874 ANXA6-206ENST00000517757 553 ntTSL 411.56□□□□□ -0.569e-7■■■■□ 24.7
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SF3A3Q12874 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.569e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CARS-215ENST00000531387 2805 ntTSL 211.5□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ZFYVE26-207ENST00000555452 7309 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MVK-209ENST00000540353 4109 ntTSL 211.45□□□□□ -0.589e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-208ENST00000469815 893 ntTSL 311.44□□□□□ -0.581e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.589e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AP1G2-229ENST00000557132 474 ntTSL 311.4□□□□□ -0.582e-25■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSPAN17-206ENST00000507471 707 ntTSL 311.37□□□□□ -0.599e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TRIM65-205ENST00000591668 644 ntTSL 211.36□□□□□ -0.599e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 311.33□□□□□ -0.69e-7■■■■□ 24.7
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SF3A3Q12874 EIF4A1-219ENST00000581770 447 ntTSL 211.21□□□□□ -0.612e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TMEM98-204ENST00000439138 896 ntTSL 311.16□□□□□ -0.629e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-247ENST00000502955 574 ntTSL 411.15□□□□□ -0.629e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.639e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-201ENST00000257435 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.654e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 COBL-204ENST00000431948 4780 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDX19A-204ENST00000562140 3121 ntTSL 510.97□□□□□ -0.659e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL928654.4-204ENST00000547184 460 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.91□□□□□ -0.669e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PLD2-215ENST00000576983 589 ntTSL 310.89□□□□□ -0.671e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EFEMP2-208ENST00000527378 614 ntTSL 310.87□□□□□ -0.679e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-205ENST00000542320 951 ntTSL 210.85□□□□□ -0.679e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TBRG4-207ENST00000477328 596 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MAPK14-206ENST00000474429 823 ntTSL 510.63□□□□□ -0.719e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDX19A-209ENST00000566574 5007 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.729e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-236ENST00000584901 1021 ntTSL 210.48□□□□□ -0.732e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.749e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CARS-206ENST00000465240 658 ntTSL 210.41□□□□□ -0.749e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDX19A-214ENST00000569771 3067 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.749e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.759e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ARHGEF17-205ENST00000543530 970 ntTSL 210.3□□□□□ -0.769e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-208ENST00000453526 559 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-224ENST00000551005 2700 ntTSL 210.27□□□□□ -0.779e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 410.22□□□□□ -0.772e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 410.22□□□□□ -0.772e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-204ENST00000374307 1868 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.781e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ZFYVE26-205ENST00000554557 7466 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.799e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-211ENST00000478284 793 ntTSL 39.96□□□□□ -0.821e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ENKD1-207ENST00000602942 1253 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.829e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TRIM65-206ENST00000592642 396 ntTSL 39.87□□□□□ -0.839e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ZFYVE26-204ENST00000554523 8582 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.849e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.849e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 59.76□□□□□ -0.852e-21■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.852e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-215ENST00000524618 1217 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.851e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RPLP1-201ENST00000260379 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.889e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GNL3-205ENST00000468146 533 ntTSL 49.58□□□□□ -0.889e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 COBL-206ENST00000445054 4660 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.889e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ELOVL6-205ENST00000506625 610 ntTSL 49.52□□□□□ -0.899e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 29.37□□□□□ -0.911e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.919e-7■■■■□ 24.7
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