Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CGNL1Q0VF96 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGNL1Q0VF96 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms