Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms