Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C2orf54Q08AI8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf54Q08AI8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms