Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKAP4Q07065 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP4Q07065 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms