Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNDQ07001 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms