Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms