Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNB3Q05901 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms