Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms