Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms