Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms