Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms