Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK3Q00526 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms