Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms