Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3AP98173 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms