Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms