Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF3P78545 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELF3P78545 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms