Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP1P78357 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP1P78357 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms