Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASIC1P78348 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms