Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPNP63162 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms