Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOBP62745 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOBP62745 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHOBP62745 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHOBP62745 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHOBP62745 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOBP62745 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOBP62745 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOBP62745 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOBP62745 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHOBP62745 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHOBP62745 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms