Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVS71-1P61550 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms