Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPS3AP61247 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms