Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms