Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCBP4P57723 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms