Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BACE1P56817 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BACE1P56817 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BACE1P56817 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BACE1P56817 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms