Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB4P54760 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms