Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD23BP54727 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD23BP54727 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD23BP54727 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23BP54727 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms