Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PGGT1BP53609 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PGGT1BP53609 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PGGT1BP53609 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PGGT1BP53609 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PGGT1BP53609 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PGGT1BP53609 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PGGT1BP53609 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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