Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB28P51157 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms