Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMPHP49418 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AMPHP49418 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMPHP49418 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMPHP49418 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMPHP49418 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMPHP49418 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMPHP49418 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMPHP49418 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMPHP49418 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMPHP49418 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMPHP49418 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPHP49418 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPHP49418 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPHP49418 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPHP49418 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPHP49418 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMPHP49418 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms