Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms