Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCAMP43121 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCAMP43121 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms