Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECI1P42126 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ECI1P42126 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECI1P42126 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECI1P42126 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECI1P42126 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ECI1P42126 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms