Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK1P39086 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms