Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAEP38570 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms