Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GGCXP38435 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGCXP38435 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms