Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP62P37198 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP62P37198 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms